不論采用何種類型的無土栽培，幾個最基本的環節必須掌握，無土栽培時營養液必須溶解在水中，然后供給植物根系。基質栽培時，營養液澆在基質中，而后被作物根系吸收。無土栽培尤其是水培系統中，根系生長受到基質尺寸的限制，一旦營養液不能滿足植株需求，作物生長就會立即受到限制。所以對水質、營養液和所用的基質的物理、化學性狀，必須有所了解。
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無土栽培的水質要求比一般農田灌溉水的要求高，但可低于飲用水的水質要求。尤其是對水培，因為它不像土壤栽培具有緩沖能力，所以許多元素含量都比土壤栽培允許的濃度標準低，否則就會發生毒害，無土栽培的水，PH值不要太高或太低，因為一般作物對營養液PH的要求從中性最好，如果水質本身PH值偏高或低，就要用酸或堿進行調整，既浪費藥品又費時費工。
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其次，營養液是無土栽培的關鍵，不同作物要求不同的營養液配方。養液配方中，差別最大的是其中氮和鉀的比例。要考慮到化學試劑的純度和成本，生產上可以使用化肥以降低成本。配置的方法是西安配出母液（原液），在進行稀釋，可以節省容器便于保存。同時要現配現用，盡量避免形成沉淀。
最后，硬度是非常重要的指標，決定著營養液的配制。根據水中含有鈣鹽和鎂鹽的數量可以將水分為軟水和硬水。硬水中鈣鎂含量高，所以在配制營養液的時候就要根據水中的鈣鎂含量來適當加減，避免鈣鎂濃度過高。硬度太高的水不適宜作為無土栽培的用水，特別是水培，通常15°以下的水用作無土栽培較為合適。
所以在無土栽培種植中，一般使用井水和自來水為主，但是河水、泉水、湖水、雨水也可用于營養液配制。無論采用何種水源，使用前都要經過分析化驗以確定水質是否適宜。